হেপাটোবিলিয়ারি এমআরটি যকৃত, অগ্ন্যাশয়, এবং পিত্তলকুলের জীবাণু সনাক্ত এবং চরিত্রের জন্য ব্যবহার করা হয়। লিভারের ফোকাল বা ফুটা রোগের সংশ্লেষণ-ওজনযুক্ত, বিরোধিতা-ফেজ ইমেজিং এবং গতিশীল কনট্রাস্ট বর্ধন সিকোয়েন্স ব্যবহার করে মূল্যায়ন করা যেতে পারে। লিভার এমআরআই এবং নতুন হেপটবিলিয়ারিয়াল কনট্রাস্ট এজেন্টগুলিতে প্রস্রাবকুলার বিপরীতে এজেন্ট ব্যাপকভাবে ব্যবহার করা হয় যা কার্যকরী বিলিয়াল ইমেজিং করার সুযোগও প্রদান করে। চুম্বকীয় অনুরণন চোলাইয়াগ্রাফিক্যানগ্রাফ্রোগ্রাফি (এমআরসিপি) -তে প্রচন্ডভাবে T2- ভরাট ক্রম ব্যবহার করে পিতলের নলগুলির শারীরিক ইমেজিংটি অর্জন করা হয়। সচরাচর নিম্নলিখিত প্রশাসনের কার্যকরী ইমেজিং সঞ্চালিত হয়। এমআর এন্টারগ্রাফি ফুসফুসীয় পেটের রোগ এবং ছোট স্তন টিউমারের অ-আক্রমণাত্মক মূল্যায়ন প্রদান করে। কোলরেট্রাল ক্যান্সারের ঝুঁকি বাড়ায় রোগীদের বৃহৎ পলিপ্স সনাক্তকরণে এমআর-কলোনোগ্রাফি একটি ভূমিকা পালন করতে পারে। 